Uma das grandes funções em que se concentra o trabalho de todo zoológico é a preservação das espécies, ao lado do lazer contemplativo e da educação ambiental.

A preservação das espécies é a função natural do PESC e talvez a mais antiga de todo o zoológico. É responsável pela manutenção de patrimônio genético, conservando indivíduos reprodutores de determinada espécie ameaçada, e de espécimes necessárias à recuperação de populações em vias de se extinguir.

É de conhecimento geral o desenvolvimento dos projetos de preservação de algumas espécies como o Mico leão dourado e no Brasil o Mico leão Dourado. Estas e outras espécies estão sendo salvas graças aos esforços de vários zoológicos no Mundo.

Trata-se de um patrimônio de toda a humanidade que ficará estacionado nos zoológicos até o dia em que possa voltar a natureza. É interessante lembrar que eles estão agora se voltando para os pequenos animais, como peixes e insetos que formam a imensa maioria dos seres vivos.